Geschiedenis
De Top 2000 was oorspronkelijk bedoeld als eenmalig initiatief om, voorafgaand aan de millenniumwisseling, de 2000 beste platen ooit, te draaien. Aan de luisteraars van Radio 2 werd vanaf begin 1999 gevraagd om een plaat met herinnering in te sturen. In de loop van 1999 werden op die manier 2000 zogenaamde millenniumplaten verzameld. Begin november 1999 werden deze 2000 platen in alfabetische volgorde op internet en teletekst geplaatst en mochten mensen stemmen voor de volgorde.De eerste versie, die van 26 tot en met 31 december 1999 werd uitgezonden, was een groot succes. Radio 2 besloot vervolgens het programma jaarlijks te herhalen en elk jaar lijkt het succes groter te worden. In 2014 luisterden 11,2 miljoen mensen naar de 'lijst der lijsten'.
In 2003 won het programma de Marconi Award voor beste amusementsprogramma van het jaar en in 2007 werd het Gouden Radio-Oortje gewonnen, als beste radio-evenement van het jaar. In 2015 won het programma de Gouden Roos, een belangrijke Europese prijs voor Radio- en TV-programma's.
Top 2000 Café
De NPS begon in 2002 met het uitzenden van het TV programmaTen slotte geeft Leo Blokhuis
Sinds 2010 is het Café van de Top 2000 ook de locatie waar vanuit de uitzendingen komen en is er ook 24 uur per dag publiek bij de uitzendingen aanwezig.
De opening door Bart Arens
Sinds 2016 wordt de Top 2000 geopend door eenWaar is Alicia?
Rond de eerste week van december wordt de stemweek gehouden en kan er gestemd worden op maximaal 35 nummers die je in de Top 2000 wil hebben. Hierbij kun je kiezen uit een lijst met ontelbaar veel nummers. Je kunt daarnaast ook zelf nummers aandragen. Dat laatste heeft soms effect, maar meestal maken nummers die niet in de keuzelijst staan, weinig kans. Dit bleek in 2020 toen het nummer Empire State of mind (part II) broken down van Alica Keys niet meer in de keuzelijst te vinden was. Stond het nummer in 2019 nog op plaats 494. vanaf 2020 is het nummer uit de Top 2000 verdwenen. Waarom dit nummer uit de keuzelijst verdween, blijft gissen. Mogelijk omdat het nummer gebaseerd is op Empire State of Mind dat rapper Jay-Z samen met Alicia Keys opnam. Maar daar staat tegenover dat er wel meer covers in de Top 2000 staan en eigenlijk is dit geen cover, maar een nieuwe akoestische op zich zelfstaande variant. Opmerkelijk daarbij is dat het nummer van Jay-Z en Alicia Keys in 2020 een grote sprong maakte en van plaats 782 naar 309 steeg. Daarmee wordt het effect van de keuzelijst nog maar eens bevestigd.In 2024 stond het nummer weer wel in de keuzelijst. Dat had echter niet het gehoopte effect want het nummer is niet teruggekeerd in de lijst. Het nummer van Jay-Z met Keys staat er wel in en steeg zelfs bijna honderd plaatsen naar positie 295.